بدأت أطباء بلا حدود العمل في ألبانيا لأول مرة في عام 1981، حيث وزعنا الإمدادات الطبية في أنحاء البلاد قبل اندلاع الحرب في كوسوفو وساعدنا وزارة الصحة على تطوير برنامج رعاية طويل المدى في مستشفى فيير في جنوب ألبانيا.

وعندما بدأ الأشخاص الفارون من كوسوفو بالوصول إلى ألبانيا في عام 1999، بدأت أطباء بلا حدود بتقديم المساعدة للاجئين في المخيمات ومراكز الاستقبال والمستشفيات والنقاط الصحية والأشخاص الذين يعيشون في القرى النائية في جميع أنحاء البلاد، وشمل ذلك المساعدات الطبية وخدمات المياه والصرف الصحي.