افتتحت المنظمة عام 2015 برنامجاً لتعزيز توفير رعاية المصابين بفيروس نقص المناعة المكتسبة بين المجموعات المستضعفة كالمهاجرين ومتعاطي المخدرات الوريدية . ومنذ ذلك الحين والمنظمة تعمل عن كثب مع منظمتين جزائريتين في عدد من المراكز التي تديرها وزارة الصحة وشركاء آخرون يقع أحدها في مدينة عنابة الساحلية. تسهم فرق أطباء بلا حدود في التوعية باستراتيجيات الوقاية من الفيروس من خلال أنشطة توعية صحية تستهدف المجموعات المعرضة لخطر الإصابة. كما تقدم الفرق خدمات الفحص في البيوت وتدعم تقنياً مراكز إحالة بهدف توحيد العلاج والمراقبة والبروتوكولات. تبرعت المنظمة كذلك في عام 2016 بمعدات مخبرية ودعمت لامركزية الرعاية.