Depuis 2012, MSF offre des soins primaires et en santé mentale dans sa structure de Zarzis, une ville côtière du Sud-Est de la Tunisie. Pour répondre à des besoins accrus, les activités médicales ont été intensifiées pour couvrir les migrants et les communautés vulnérables de Sfax, une grande ville située à 280 kilomètres au Nord de Zarzis. Une équipe a continué de dispenser des soins médicaux aux résidents du camp de Choucha, près de la frontière libyenne. En 2016, les cliniques de MSF ont assuré 384 consultations médicales et traité 226 nouveaux patients venant principalement d’Afrique sub-saharienne mais aussi de Syrie, Libye et Tunisie. MSF a soutenu les efforts déployés localement pour gérer les souffrances et les morts en mer, à travers des opérations de recherche et sauvetage et la formation de pêcheurs tunisiens et libyens, garde-côtes, membres de la protection civile et de la douane tunisiennes et Croissant-Rouge libyen à la gestion des corps. Plus de 230 personnes ont participé aux deux séries organisées en mars et juin, soit les mois correspondant au pic de la saison des migrations. MSF a également donné du matériel médical et 9826 équipements de protection individuelle et de sauvetage aux stagiaires.  En outre, MSF a donné à trois hôpitaux des kits d’urgence comprenant suffisamment de médicaments et de matériel médical pour faire face à un afflux de 50 blessés.