La peste est endémique à Madagascar. Mais en 2017, l'épidémie a été exceptionnelle, car elle était causée par la forme pneumonique, plus mortelle, qui se transmet d'humain à humain, au lieu de la forme bubonique, transmise par de petits mammifères. D'août à début décembre, plus de 2'400 personnes l'ont contractée et 209 en sont mortes.<a href="http://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/259635/oew49-29122017.pdf;jsessionid=66217FFC0167407BAD78A05C88151B25?sequence=1">World Health Organization’s Health Emergency Information and Risk Assessment, 4 décembre 2017</a>

La ville portuaire de Tamatave (aussi appelée Toamasina), sur la côte est de Madagascar, a concentré le plus grand nombre de cas après Antananarivo, la capitale. En octobre, MSF a participé à la l’ouverture et la gestion du centre de triage et de traitement de la peste. L'équipe s'est attachée à améliorer les mesures d'hygiène et de contrôle de l’infection dans et autour du centre, à former du personnel médical, à mener des actions de promotion de la santé dans les communautés et à améliorer le triage des patients. 

En novembre, l'épidémie était sous contrôle et MSF a commencé à réduire ses activités à Tamatave. L'équipe est restée quelques semaines pour évaluer les risques sanitaires liés à la peste autour d'Antananarivo et a renforcé les systèmes de triage des patients et de gestion des déchets au Centre hospitalier anti-peste d’Ambohimiandra, à Antananarivo, l'unique structure spécialisée dans le traitement de la maladie sur l'île.

À Ambalavao, dans la région de Haute Matsiatra, MSF a ouvert un centre de triage et de traitement de la peste pour améliorer la prévention de l’infection et la gestion des déchets. L'équipe a aussi organisé des actions de sensibilisation dans la communauté pour aider le ministère de la Santé à faire face à de futures épidémies.