À Arua, notre programme VIH cible les enfants et adolescents ainsi que les personnes aux stades avancés de la maladie ou avec une charge virale élevée, en particulier les patients en échec thérapeutique qui ont besoin d’un traitement de troisième intention. Dans le district de Kasese, nous facilitons l'accès au dépistage du VIH et simplifions le suivi et le renouvellement des médicaments pour les pêcheurs autour des lacs George et Edward, afin qu'ils puissent continuer de travailler. 

Notre clinique pour adolescents à Kasese offre un espace sûr pour recevoir des soins en santé sexuelle et génésique. Nous y assurons contraception, traitements des maladies sexuellement transmissibles, soins pré- et postnatals, soins aux victimes de violence sexuelle et fondée sur le genre et avortements médicalisés. Des activités récréatives les incitent à venir au centre. 

Des équipes de MSF travaillent dans les camps de réfugiés du nord de l'Ouganda depuis l’arrivée de réfugiés sud-soudanais en 2016. Après le transfert de certaines activités en 2018, nous nous concentrons sur la prise en charge médicale et psychologique des victimes de violence sexuelle et fondée sur le genre dans le camp d'Omugo et pratiquons les avortements médicalisés. 

Ces dernières années, l'Ouganda a connu des épidémies récurrentes d'Ebola et de fièvre de Marburg. Après que la République démocratique du Congo (RDC) a déclaré une épidémie d'Ebola début août 2018, MSF a commencé à aider la task force nationale ougandaise à améliorer sa préparation de la réponse à Ebola. Nos équipes ont créé des unités de traitement Ebola dans les districts voisins de la RDC. Seulement trois cas d'Ebola ont été confirmés en Ouganda en 2019.